Ранее он уже выступал за «быков» в сезонах 2012 и 13/14.Карьера Игоря Смольникова получила активное развитие в «Краснодаре», с которым он подписал контракт 2 июня 2012 года. Крайний защитник отыграл за «быков» 31 матч, закрепился в основном составе и в начале следующего сезона был куплен петербургским «Зенитом». В том же 2013 году Игорь дебютировал в национальной сборной России.

За 7 лет в составе «Зенита» Смольников стал трехкратным чемпионом России, выиграл Кубок страны и несколько раз становился призером Тинькофф РПЛ. Летом 2020 года срок его трудового соглашения с петербургским клубом истек, и 31-летний защитник в статусе свободного агента вернулся в «Краснодар».

Игорь Смольников подписал с «Краснодаром» двухлетний контракт с опцией продления еще на один сезон, который вступит в силу 1 августа 2020 года.